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微生物多样性测序
产品介绍

微生物多样性测序 微生物多样性检测通过对环境中微生物16S rDNA/18S rDNA/ITS序列进行高通量测序,分析该环境下微生物群落的多样性和分布规律。微生物多样性检测对于我们研究微生物与疾病的关系、环境治理和微生物资源利用有着重要的理论和现实意义。

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样本要求 1. DNA样:基因组DNA用TE或Nuclease-free Water溶解;总量≥1 μg;OD260/280在1.8-2.0之间;浓度≥50 ng/μL。DNA完整纯净,无降解,无细胞凋亡,无RNA、蛋白质、多糖、试剂成分等残留或污染。
注  意:某些植物DNA样本需要专门去除多糖。
2. 组织样:土壤样品:5-10 g;粪便:3-5 g;水体:1-3 L水样用0.22 μm滤膜过滤后的滤膜;粘膜:指甲大小;植物内生菌:叶片10-20 g、根系3-5 g;底泥:4-10 g;大气:滤膜上可见覆盖物;叶片表面:50-100 g。物体表面/皮肤:几个棉拭子。
以上类型样品取样后速冻,干冰运输。




承诺指标 平均6万条最低3万条clean tags,Illumina PE250测序,Q30≥85%




分析内容 1. 数据质控;
2. OTU聚类、注释;
3. 样本复杂度分析;
4. 多样品比较分析;
5. 微生物群落丰度及多样性分析;
6. 样品间差异分析;
7. 物种组成与环境因子关联分析;
8. 功能预测分析。
9. 其他高级分析




应用领域 人类疾病与微生物关系的研究;
动植物微生物研究;
宿主环境微生物研究;
工业微生物研究;
生态微生物研究等