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宏基因组测序
产品介绍

宏基因组测序 宏基因组测序是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,无需分离培养,直接提取环境样本DNA进行的测序,研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等,已广泛应用于微生物领域。

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样本要求 1. DNA样:基因组DNA用TE或Nuclease-free Water溶解;总量≥1 μg;OD260/280在1.8-2.0之间;浓度≥50 ng/μL。DNA完整纯净,无降解,无细胞凋亡,无RNA、蛋白质、多糖、试剂成分等残留或污染。
注  意:某些植物DNA样本需要专门去除多糖。
2. 组织样:土壤样品:5-10 g;粪便:3-5 g;水体:1-3 L水样用0.22 μm滤膜过滤后的滤膜;粘膜:指甲大小;植物内生菌:叶片10-20 g、根系3-5 g;底泥:4-10 g;大气:滤膜上可见覆盖物;叶片表面:50-100 g。物体表面/皮肤:几个棉拭子。
以上类型样品取样后速冻,干冰运输。




承诺指标 5G/10G数据量,Illumina PE150测序,Q30≥85%




分析内容 1. 数据质控;
2. 基因组装;
3. 物种、基因功能注释及丰度分析;
4. 组间功能差异及物种差异分析




应用领域 研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等